未知代謝物鑒定檢測技術服務-詳情介紹:
代謝組學一般根據(jù)以下四個維度對代謝物鑒定的可信度進行劃分:可靠的鑒定得到的化合物(1級),通過假定注釋得到的化合物(2級),通過假定注釋對化合物類別進行鑒定(3級)和未知化合物(4級)。1級鑒定需要將目標代謝物的兩個或多個正交特性(如保留時間、m/z和碎片質譜)與在相同分析條件下觀察到的真實化學標準品的相同特性進行比較。推定(第2級或第3級)注釋基本上僅依賴于一個或兩個特性,且通?;趯Σ煌瑢嶒炇沂占囊约安煌治龇椒ǐ@得的數(shù)據(jù)的比較,而不是在相同分析條件下與真正的化學標準品的直接比較。
未知代謝物指可以反復檢測到的但其化學身份尚未確定的小分子。這些化合物雖然尚未被鑒定和分類,但在代謝組學實驗中仍可根據(jù)光譜數(shù)據(jù)進行區(qū)分和定量。在LC-MS實驗中,一個未知化合物將由唯|yi的保留時間、一個或多個質量或一個特定的初級離子碎片模式定義。在NMR實驗中,一個未知化合物將由化學位移的模式定義。未知物可能代表先前沒有被識別的小分子,例如代謝的次級產(chǎn)物或罕見的外源性物質,或者它們可能由已建立的途徑構成分子但無法分配到現(xiàn)有的NMR參考譜庫或MS碎裂模式。
未知化合物的鑒定非常耗時且成本高昂,通常需要進行制備規(guī)模的分離以進行NMR研究,或大量的化學合成才能使用MS/MS進行結構比較。因此,大多數(shù)報告都集中于檢測具有可用的真實商業(yè)標準品或至少存在于代謝物數(shù)據(jù)庫中的代謝物,即分類為1級,2級和3級的代謝物。由于許多代謝物固有的不穩(wěn)定性和需求的缺乏,僅有數(shù)千種商業(yè)分析標準品可用。然而,這些標準品和數(shù)據(jù)庫中存在的代謝物僅占內源性代謝物很小的一部分。因此,對于代謝組學研究來說,有效的方法來排序、研究和zuì |終鑒定非特征代謝物是非常重要的。未知代謝物的成功鑒定將對生物標志物的發(fā)現(xiàn)和組學研究產(chǎn)生重大影響。
未知代謝物鑒定
為了鑒定代謝組學樣品中的未知化合物,應區(qū)分不同類別的代謝物,具有相同可分辨公稱質量(nominal mass)的,具有相同可分辨公稱質量但分子式和同位素質量不同的,相同可分辨公稱質量和同位素質量但化學結構不同的,都應該對其進行區(qū)分。例如,亮氨suān |和異亮氨suān |是結構不同的異構tǐ |,但是可分辨公稱質量和同位素質量相同。此外,由于單一代謝物可以在質譜儀中檢測到不同的衍生物種,所以正確地將不同的衍生物種分配給母tǐ |代謝物也是很重要的。例如,在氨基suān |分析中,三甲基硅wán |化(TMS)與氨基suān |發(fā)生化學衍生反應會生成含有1、2或3個TMS基團的氨基suān |,這些氨基suān |都應屬于同一母tǐ |氨基suān |。
百泰派克生物科技結合NMR,LC-MS/MS和生物信息學分析法,提供基于質譜的識別未知代謝物的分析服務,可以準確鑒定復雜生物樣品中的代謝物。百泰派克生物科技不斷開發(fā)工具和數(shù)據(jù)庫,期望能夠實現(xiàn)以自動化的方式對所有代謝物進行真實和完整的鑒定。歡迎咨詢!
未知代謝物鑒定檢測技術服務-詳情介紹
百泰派克生物科技-生物藥物表征,生物質譜多組學優(yōu)質服務商
北京百泰派克生物科技有限公司(Beijing Bio-Tech Pack Technology Company Ltd. 簡稱BTP)從事以生物質譜為依托的生物藥物表征,大分子物質(包括蛋白質、多肽、代謝物)質譜分析以及小分子物質檢測服務。
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