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賽默飛ABI Ion GeneStudio S5基因測序儀

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更新時間:2022-03-03 18:16:46瀏覽次數(shù):813次

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賽默飛ABI Ion GeneStudio S5基因測序儀:無需復(fù)雜的光路系統(tǒng), Ion Torrent半導(dǎo)體測序技術(shù)利用天然核苷酸反應(yīng), 實現(xiàn)高精度的變異捕獲、 極其均一的覆蓋度以及高度的檢測靈敏度來探測低頻變異。

賽默飛ABI Ion GeneStudio S5基因測序儀主要性能

• 無需復(fù)雜的光路系統(tǒng), Ion Torrent半導(dǎo)體測序技術(shù)利用天然核苷酸反應(yīng), 實現(xiàn)高精度的變異捕獲、 極其均一的覆蓋度以及高度的檢測靈敏度來探測低頻變異。
• 相比市場上其他基于光學(xué)檢測技術(shù)的測序平臺, IonS5系統(tǒng)幫助希望引入新一代測序技術(shù)的實驗室降低初期投入成本。
• 支持多種不同價格和通量的半導(dǎo)體芯片(Ion 510™、Ion 520™、 Ion 530™和Ion 540™芯片), 從而為用戶開展各類DNA/RNA測序應(yīng)用項目提供更大的靈活性。
• 提供快的新一代測序儀運行速度。
• 依托用戶與技術(shù)開發(fā)者社區(qū)-Ion社區(qū)(IonCommunity)-這一社區(qū)目前已擁有超過3萬名會員,會員人數(shù)仍在每天增長中。
• 較小的桌面占用空間, 僅需不到0.5平方米 (儀器尺寸:54.2 x 80.6 x 50.9 cm) 。
• 提供廣泛的文庫制備方案與試劑盒選擇, 操作簡單、快速, 起始樣品需求量極低, 適用于微生物測序、靶向基因測序、 外顯子組測序, 以及RNA測序等廣泛研究應(yīng)用。
• 與Ion Chef™系統(tǒng)或Ion OneTouch™ 2系統(tǒng)配合使用, 實現(xiàn)簡易快速的模板制備。
• 通過整合的T630服務(wù)器與Torrent Suite™軟件, 實現(xiàn)從堿基識別到變異解析的完整解決方案。
• 運用Ion Reporter™軟件對配對樣品DNA變異的檢測和分析, 提供簡易和整合的三級數(shù)據(jù)分析工具。

賽默飛ABI Ion GeneStudio S5基因測序儀技術(shù)參數(shù)與應(yīng)用

 

性能描述
簡捷的靶向測序流程"簡單、 快速的自動化工作流程: 靶向測序應(yīng)用中, 從DNA樣品輸入到獲
得分析數(shù)據(jù)*的完整過程中手工操作不到45分鐘"

• 文庫制備:
– Ion Xpress Plus片段文庫試劑盒: 15分鐘(手工操作時間)
– 使用AB Library Builder實驗方案實現(xiàn)自動化文庫制備(13份樣品): 10分鐘(手工操作時間)
– Ion AmpliSeq靶向富集和建庫技術(shù):
  • 手動建庫方案: 60分鐘(手工操作時間)
  • Ion Chef系統(tǒng)自動化建庫方案: 15分鐘(手工操作時間)
• 模板制備:
– Ion OneTouch 2系統(tǒng): 模板擴(kuò)增, 手工操作時間2.5小時
– Ion Chef系統(tǒng): 模板擴(kuò)增與芯片上樣, 手工操作時間15分鐘
• 測序:
– 手工操作時間少于15分鐘
• 數(shù)據(jù)分析:
– 從5百萬讀值數(shù)據(jù)(200 bp測序反應(yīng))獲得比對好的BAM文件, 操作時間不到5小時"
快速的新一代測序從DNA樣品到獲得變異結(jié)果快僅需兩個工作日(8小時計算)

• 測序反應(yīng)僅需2.5-4小時即可完成


• 使用Ion Xpress Plus片段文庫試劑盒時, 基因組DNA與擴(kuò)增文庫制備僅需2.5小時; 使用Ion AmpliSeq靶向富集技術(shù)時, 僅需3.5個小時
• 在Ion Chef系統(tǒng)上, 自動對兩塊Ion S5芯片進(jìn)行模板制備與芯片上樣
• 在Ion S5 Torrent服務(wù)器上進(jìn)行數(shù)據(jù)分析, 數(shù)小時之內(nèi)完成變異檢測報告

高度靈活的通量四款芯片分別提供從2百萬至8千萬的序列通量, 用戶可以根據(jù)需求靈活選擇

每周樣品通量高每周可完成更多數(shù)量樣品的完整靶向測序工作流程

• 模塊化工作流程設(shè)計, 支持用戶每周(5個工作日)進(jìn)行多次測序*: 每臺Ion S5系統(tǒng)每周可完成多達(dá)10次測序(200堿基讀值)
• 模塊化工作流程, 研究人員能夠在一臺Ion S5系統(tǒng)上多可同時操作384份標(biāo)記樣品, 每周多可檢測3840份獨立DNA樣品
* 工作日以8小時計算。
簡捷、 直觀的系統(tǒng)盒裝試劑與友好的用戶界面, 為用戶提供一個簡捷的測序流程

• 在Ion Chef系統(tǒng)、 Ion OneTouch 2系統(tǒng)和Ion S5系統(tǒng)上, 用戶可使用直觀的觸摸界面進(jìn)行編程和操控
• 用戶可通過固定或移動設(shè)備(如iOS和Android設(shè)備)遠(yuǎn)程監(jiān)控Ion S5測序儀
• 行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)格式(FASTQ、 SFF、 BAM、 VCF), 兼容第三方生物信息學(xué)軟件提供的下游分析和可視化工具。
• 模塊化工作流程, 可在文庫制備到測序的每一個環(huán)節(jié)中實施質(zhì)量控制, 幫助用戶節(jié)約時間, 降低試劑成本。
• 通過盒裝試劑與完整樣品跟蹤功能(RFID掃描)優(yōu)化流程, 提高效率
長堿基讀長• 200-、 400-與600-堿基讀長
• 兼容長mate-pair讀長
*硬件牢固而簡潔的硬件值得您信賴

• 設(shè)計簡單, 無冗余的活動零件或復(fù)雜的附屬系統(tǒng), 穩(wěn)健可靠
• 標(biāo)準(zhǔn)臺式系統(tǒng)(Ion S5系統(tǒng)與Ion Chef系統(tǒng)或Ion OneTouch 2系統(tǒng)), 提供完整擴(kuò)增與測序工作流程
• 用戶可通過Ion S5系統(tǒng)的外置條碼閱讀器追溯芯片和樣品, 通過Ion S5 Torrent服務(wù)器實現(xiàn)樣品登記
• Ion Chef系統(tǒng)與Ion S5系統(tǒng)采用了優(yōu)的識別系統(tǒng), 對編碼耗材進(jìn)行識別和追蹤, 并將信息集成至Torrent Suite軟件和/或LIMS系統(tǒng)
• 所有Ion S5系統(tǒng)均由符合ISO 13485標(biāo)準(zhǔn)的工廠生產(chǎn)
緊湊型臺式系統(tǒng)Ion S5 XL系統(tǒng)僅占用很小的桌面空間

• 尺寸(W x D x L) (近似值): 21.4 x 31.75 x 20 in. (54.2 x 80.6 x 50.9 cm)
• 占用面積: 4.72 平方英尺
• 重量(近似值): 140 lb/63.5 kg
提供完整產(chǎn)品組合高性價比的新一代測序平臺, 廣泛適用于各類DNA與RNA研究應(yīng)用
低序列偏性高度均一的覆蓋度及精確的變異檢測

• Ion 510/520/530 Kit-Chef與Ion 520/530 Kit-OT2能夠?qū)?00和400堿基文庫進(jìn)行精確、 可靠的測序
• Ion 540 Kit-Chef與Ion 540 Kit-OT2能夠?qū)?00堿基文庫進(jìn)行精確、 可靠的測序
• Ion 520/530 ExT Kit-Chef能夠?qū)?00堿基文庫進(jìn)行精確、 可靠的測序
• 通過簡單的天然化學(xué)反應(yīng)過程獲得均一的覆蓋度(即無偏性)
• 基于天然核苷酸, 聚合酶或核苷酸上無附著的熒光基團(tuán), 從而實現(xiàn)長堿基讀長和堿基識別的高保真度

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