Clarity TM 聯(lián)管式芯片數(shù)字PCR系統(tǒng)

數(shù)字PCR是可以實(shí)現(xiàn)分子定量的儀器，和PCR技術(shù)、熒光定量PCR（qPCR）技術(shù)相比，具有定量?jī)?yōu)勢(shì)，和高通量測(cè)序（NGS）相比，又具有較高的靈活性，兼具成本把控優(yōu)勢(shì)。JN Medsys的數(shù)字PCR（Clarity TM）是一種新型的數(shù)字PCR，可實(shí)現(xiàn)分子的定量。不同于微滴式數(shù)字PCR，該儀器采用了8聯(lián)管管內(nèi)芯片設(shè)計(jì)，分區(qū)更穩(wěn)定，無需移液步驟，數(shù)據(jù)更準(zhǔn)確。每個(gè)上樣管內(nèi)部的高密度芯片擁有10000個(gè)分區(qū)，擁有高靈敏。具有優(yōu)勢(shì)：8聯(lián)管兼容市面上的普通PCR儀和試劑，降低實(shí)驗(yàn)成本；采用了封閉式系統(tǒng)，減小了污染；全自動(dòng)分區(qū)，利用表面張力、虹吸原理上樣，分區(qū)速度小于1分鐘；分析速度在同類儀器中突出，96個(gè)反應(yīng)時(shí)間僅為4小時(shí)。十分適合低豐度分子的高靈敏度、定量分析。

1.8聯(lián)管管內(nèi)芯片設(shè)計(jì)技術(shù)

檢測(cè)時(shí)不依賴傳統(tǒng)的Ct值即可實(shí)現(xiàn)真正意義上的定量，從而提供了比實(shí)時(shí)熒光定量PCR更精確的基因差異表達(dá)研究，尤其對(duì)于那些靶基因表達(dá)差異微小的情況，比如等位基因的不平衡表達(dá)以及單細(xì)胞基因表達(dá)分析等；

2. 其他基因組學(xué)及表觀遺傳學(xué)相關(guān)研究

①拷貝數(shù)變異(CNV)研究：

通過8連管內(nèi)芯片上上萬個(gè)分區(qū)對(duì)樣本進(jìn)行處理及后續(xù)擴(kuò)增，擺脫Ct值的計(jì)算方法而直接獲取目標(biāo)基因的拷貝數(shù)，為拷貝數(shù)變異的研究提供了的檢測(cè)精度。還可進(jìn)行NGS文庫(kù)定量，成本低、通量高。

②稀有突變檢測(cè)：

對(duì)于稀有突變檢測(cè)，定量PCR、及NGS等方法都因受到背景DNA的干擾，使得檢測(cè)靈敏度及精確性都達(dá)不到精細(xì)定量的要求(如定量PCR檢測(cè)中Ct值大于33的情況下，其重復(fù)性就不是很高)， 而JNMedsys ClarityTM Digital PCR通過對(duì)樣本的上萬個(gè)分區(qū)處理，使得稀有突變從大量的背景DNA中分離出來，從而提高了檢測(cè)的靈敏度及重復(fù)性。

3. 醫(yī)學(xué)分子檢測(cè)

①精準(zhǔn)醫(yī)療（轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)）的應(yīng)用：

如肺癌等相關(guān)的EGFR、KARS、BRAF基因的SNP突變檢測(cè)、乳腺癌的HER2基因檢測(cè)等從而指導(dǎo)各種靶向藥物的選擇與用藥方案的調(diào)整。

②疾病超早期分子檢測(cè)：

隨著研究的展開，很多實(shí)驗(yàn)室發(fā)現(xiàn)基于ddPCR對(duì)于諸如血液、痰液、尿液等體液樣品中核酸水平的疾病相關(guān)標(biāo)記分子（DNA、mtDNA、miRNA等）的檢測(cè)，其發(fā)現(xiàn)疾病的時(shí)間遠(yuǎn)早于影像學(xué)或其他蛋白類標(biāo)記物的相關(guān)檢測(cè)，而且結(jié)果的靈敏度更高，穩(wěn)定性更好，與傳統(tǒng)的核酸檢測(cè)方法相比，大大提前了疾病發(fā)現(xiàn)的窗口期，更好地實(shí)現(xiàn)對(duì)疾病的早發(fā)現(xiàn)，早治療。

4 病原微生物的檢測(cè)（病毒、細(xì)菌等）

疾病預(yù)防控制中心、系統(tǒng)的實(shí)驗(yàn)室目前主要采用基于TaqMan探針法的定量PCR體系對(duì)病原微生物進(jìn)行核酸水平的檢測(cè)，而這些目前正在使用著的檢測(cè)體系可以無縫地轉(zhuǎn)移到JNMedsys ClarityTM Digital PCR上，從而滿足該類實(shí)驗(yàn)室對(duì)于檢測(cè)結(jié)果的要求：靈敏度更高、重復(fù)性更好、無需依賴標(biāo)準(zhǔn)曲線的定量結(jié)果，同時(shí)操作簡(jiǎn)便。

5 轉(zhuǎn)基因食品或成分的檢測(cè)

目前在確定轉(zhuǎn)基因作物或成分的含量時(shí)采取定量PCR的標(biāo)準(zhǔn)曲線法，這種方法需要依賴于已知濃度的標(biāo)準(zhǔn)品(Certified Reference Materials Calibrants, CRMCs)。JNMedsys ClarityTM Digital PCR定量的方式可以解決這些標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)的定標(biāo)工作。