石蠟DNA，RNA同時提取試劑盒

AllPrep DNA/RNA FFPE Kit

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簡介：

從福爾馬林固定、石蠟包埋的組織切片中同時純化基因組DNA和總RNA（包括小RNAs）

1．使用小樣本量即可獲得大量純化產物

2．在純化同時，保持DNA和RNA的完整性

3．高效分離RNA和DNA

4．對同一FFPE樣本進行全面的DNA和RNA分析

如要對基因組學和轉錄組學數據進行可靠比較，則需從同一樣本中純化DNA和RNA。AllPrep DNA/RNA FFPE Kit使用優(yōu)良的溶解方法，從福爾馬林固定、石蠟包埋的組織樣本中純化DNA和RNA。純化產物適用于real-time PCR和焦磷酸測序等應用。

詳細信息：

性能

使用AllPrep DNA/RNA FFPE Kit純化的DNA和RNA的質量與使用QIAamp FFPE Tissue Kit和RNeasy FFPE Kit/miRNeasy FFPE Kit純化的產物的質量相當。因此，純化產物可用于焦磷酸測序、real-time PCR和RT-PCR等下游應用。

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原理

AllPrep DNA/RNA FFPE Kit專為從FFPE樣本中同時純化基因組DNA和總RNA而設計。該試劑盒可使用同一樣本純化DNA和RNA，而非像其他純化方法那樣，需將樣本分為兩份再分別進行純化操作。如將樣本分為兩份分別純化DNA和RNA，其純化出的DNA和RNA來自不同的細胞群落，可能具有不同性質特征。從同一樣本中同時純化DNA和RNA可減少浪費，因為FFPE樣本是十分珍貴的樣本，通常很難恢復且樣本量少。

由于固定和包埋，FFPE樣本中的核酸通常都嚴重片段化，核酸的分子量通常小于從新鮮或冷凍樣本中分離出的核酸的分子量。從同一FFPE樣本中分離DNA和RNA面臨著很大困難：片段化的DNA長度短，且部分是單鏈結構；因此其更像RNA，而非完整的DNA。片段化DNA這一特性使得用物理方法分離DNA和RNA十分困難。AllPrep DNA/RNA FFPE Kit使用優(yōu)良的溶解方法，從同一個FFPE樣本中分別釋放DNA和RNA。

盡管標準的質量控制分析（如凝膠電泳或芯片分析方法）無法檢測到甲醛的化學修飾，但其對酶分析有嚴重干擾。AllPrep DNA/RNA FFPE Kit已經過優(yōu)化，可zui大程度上逆轉甲醛化學修飾，而不引起DNA和RNA的進一步降解。

操作流程

簡單的流程可從同一個樣本中純化高品質DNA和RNA。AllPrep DNA/RNA FFPE Kit使用優(yōu)良的溶解方法，從同一個FFPE樣本中分別釋放DNA和RNA。使用這種方法時，FFPE樣本要在優(yōu)化的裂解緩沖液中孵育，使得RNA釋放出來，而DNA形成沉淀。離心后，將含有RNA的上清和含有DNA的沉淀分別處理，純化RNA和DNA。再次進行孵育有一定的解交聯作用，然后使用RNeasy MinElute或QIAamp MinElute離心柱純化RNA和DNA。用柱上DNA酶處理純化的RNA，以有效去除DNA污染。根據RNA與離心柱的結合情況，純化的RNA中可能含有也可能不含miRNA等小RNAs。對于純化后的DNA，可選擇性進行柱上RNA酶消化，因為在離心前的DNA和RNA分離步驟中RNA污染水平已達到zui低。

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應用

盡管AllPrep DNA/RNA FFPE Kit已經過優(yōu)化，可zui大程度上逆轉福爾馬林化學修飾，而不引起DNA和RNA的進一步降解；但從FFPE樣本中純化獲得的核酸不應該用于需要大分子量DNA或完整長度RNA的下游應用。一些應用可能需要進行化學修飾后，再使用片段化核酸（如：設計PCR和RT-PCR的小擴增子）。在cDNA合成中，應使用基因特異性引物，而非oligo-dT引物。如果無法使用基因特異性引物，則可使用任意引物。

技術參數：

【公司名稱】 廣州健侖生物科技有限公司

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【聯 系 人】全國東

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【電子郵件】 simon@jianlun.com

【騰訊 】

【公司】http:///

【營銷中心】 廣州市中山大道中358號東溪大廈B座511室

【公司地址】 廣州市天河區(qū)車陂第十五工業(yè)園一幢4067室