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日前，中國科學(xué)院微生物研究所趙瑞琳課題組把真菌的演化時間應(yīng)用于確定分類等級和分類系統(tǒng)重建工作中，制定了演化時間作為確定分類等級的一個新標(biāo)準(zhǔn)。她說：“在劃分單系類群的分類等級時，相同分類等級的演化時間應(yīng)大體一致；高分類等級的演化時間要早于低分類等級的原則。”相關(guān)論文已發(fā)表于真菌學(xué)領(lǐng)域的期刊。
趙瑞琳介紹了該研究思路首先在種類及進(jìn)化支序繁多的蘑菇屬上應(yīng)用，具體工作為：在 700 余世界各地樣品初步的系統(tǒng)發(fā)育分析的基礎(chǔ)上，以兩個傘菌綱化石標(biāo)本為演化時間校訂點(diǎn)，通過多基因序列的分子鐘分析，確定蘑菇屬演化形成于 6600 萬年前；在 3000 萬年前形成 6 個單系支序（被命名為亞屬）；在 2000 萬年前左右，進(jìn)一步分化出的 22 個單系支序（被命名為組）；而其他單系支序由于形成時間明顯晚于上述時間，不被劃分為任何一個種上分類單元，zui終重建了蘑菇屬的世界性分類體系，解決了蘑菇屬內(nèi)大量新進(jìn)化分支的命名分類難點(diǎn)。
趙瑞琳說：“我們首先集結(jié)近十年來擔(dān)子菌門的進(jìn)展，分別構(gòu)建了擔(dān)子菌門 6 個基因的系統(tǒng)發(fā)育圖譜，及基于 396 個直系同源基因的系統(tǒng)發(fā)育圖譜。”
隨后的分子鐘分析表明擔(dān)子菌門演化形成于 5.3 億年前，擔(dān)子菌門中 4 個亞門的演化時間為 4 億~4.9 億年前，對于具有大型子實體的傘菌綱的演化時間范圍分別為 3.4 億~3.9 億年前，具有較小子實體的銹菌亞門和黑粉菌亞門中綱的演化時間范圍分別為 2.4 億~3.4 億年前；擔(dān)子菌門中各個目的演化時間為 1.2 億~2.9 億年前。
因此，趙瑞琳建議把這些演化時間作為建立擔(dān)子菌門中目及目以上分類等級的一個依據(jù)。借助于演化時間這一新標(biāo)準(zhǔn)，還新認(rèn)定一個亞門 Wallemiomycotina；發(fā)現(xiàn) 1 個目由于過于年輕的演化時間建議廢除；2 個科由于具有的古老演化時間，分別正式提升為 2 個目。
趙瑞琳課題組的研究表明，演化時間可以成為劃分真菌分類等級的一個新標(biāo)準(zhǔn)，而且給出了擔(dān)子菌門劃分亞門、綱、亞綱和目的演化時間范圍標(biāo)準(zhǔn)。此研究方法為解決大量發(fā)現(xiàn)的新進(jìn)化支序的合理分類問題，制定更客觀和穩(wěn)定的分類系統(tǒng)提供新的依據(jù)，目前已在其他類群（如子囊菌門，表生真菌等）的系統(tǒng)學(xué)研究中采用。
