Neosuite CNPD 中國天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫 (Chinese Natural Product Database, NeoSuite)     

     Neosuite CNPD 中國天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫 [Chinese Natural Product Database (CNPD^TM)] 是創(chuàng)騰科技有限公司和*上海藥物研究所聯(lián)合開發(fā)的綜合性天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫。這一數(shù)據(jù)庫是在 ISIS 化學信息管理系統(tǒng)的基礎上建立并完成的。ISIS 化學信息管理系統(tǒng)是目前通用的管理系統(tǒng)，使用方便, 兼容性好。

     CNPD^TM 是面向相關領域的科學家建立的易于使用的綜合性天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)，該產(chǎn)品力圖系統(tǒng)的收集、整理、分析從中國國產(chǎn)的植物中分離鑒定出的天然產(chǎn)物的物理性質(zhì)、生物活性及化學結構等信息，結合中國傳統(tǒng)中草藥的應用實踐，利用*的計算機化學信息管理手段，為中國的新藥、天然產(chǎn)物及相關領域的研究與開發(fā)工作，提供一個*的好工具。

CNPD^TM——物有所值的天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫

     CNPD^TM 數(shù)據(jù)庫包括兩方面內(nèi)容：一是庫管理系統(tǒng)，二是數(shù)據(jù)本身。

    CNPD^TM 數(shù)據(jù)庫的一個重要方面是管理系統(tǒng)。CNPD^TM 的數(shù)據(jù)庫是利用*的化學信息管理系統(tǒng) ISIS/Base & Draw 進行數(shù)據(jù)管理，可以方便地連接其他應用系統(tǒng)如 BIOVIA 所提供的分子模擬和分子設計軟件系統(tǒng) Discovery Studio。 ISIS/Base & Draw 在 Windows 環(huán)境下運行，使用者無需任何專業(yè)計算機知識 , 不需學習任何編程語言 , 即可利用 ISIS/Base & Draw 對 CNPD^TM 數(shù)據(jù)庫自如地進行檢索、瀏覽和維護。更重要的是，使用者在使用 ISIS/Base & Draw 對 CNPD^TM 數(shù)據(jù)庫進行檢索時，還可以使用到一種非常有效的新功能結構式搜尋。化學結構式是化學家的通用語言，當化學家利用結構式搜尋功能對 CNPD^TM數(shù)據(jù)庫進行檢索時， 可以非常準確的得到他們所需的信息。

     CNPD^TM 數(shù)據(jù)庫的另一個重要內(nèi)容便是數(shù)據(jù)本身。CNPD^TM 目前共收集了五萬七千多個天然產(chǎn)物，涵蓋天然產(chǎn)物的三十七個類別。而且類藥性分析結果標明，CNPD^TM 中有 70％的分子是類藥性分子。

     同時 CNPD^TM 還收集了天然產(chǎn)物相關的各類信息，主要包括：

• 天然產(chǎn)物的二維分子結構及三維分子結構。三維分子結構是利用分子力學方法優(yōu)化得到的。導出的三維分子結構不僅可以進行針對藥物靶標的虛擬篩選，而且可以將三維分子結構與生物活性資料相結合，來探索分子結構和活性間的相互關系。

•  天然產(chǎn)物的名稱、分子式、分子量、熔點、旋光度等重要理化性質(zhì)。

•  天然產(chǎn)物的 CAS 登錄號。CAS 登錄號可以作為與其它化學信息資源關聯(lián)的便捷接口。

•  一些天然產(chǎn)物的生物活性信息及其參考文獻。包括文獻來源、作者、年代等詳細信息。

•  天然產(chǎn)物的自然來源及其參考文獻。包括文獻來源、作者、年代等詳細信息。

•  原植物或其同屬中藥在中國傳統(tǒng)醫(yī)藥中的應用。包括中文名，拉丁文名，性味，歸經(jīng)及功用主治等。

CNPD^TM 的應用
     CNPD^TM 可以為從事藥物化學、植物化學、有機化學、醫(yī)藥、農(nóng)藥及生物化學等領域的研究人員提供有益的幫助，例如：
• 幫助研究人員系統(tǒng)的了解天然產(chǎn)物分離、提取和鑒定的研究方法。
• 對天然產(chǎn)物的結構及生物活性信息進行定量或定性的分析研究，深入了解某類藥物的結構與活性之間的關系, 為新藥研究提供系統(tǒng)的和有價值的信息。
• 通過虛擬篩選方法篩選天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫CNPD^TM 也是獲得先導化合物或活性化合物的一條有效途徑。
• 由于天然產(chǎn)物的結構具有非常好的差異性, 因此天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫中的許多化合物可以作為組合化學庫設計的起始結構。
• CNPD^TM *將天然產(chǎn)物、生物活性數(shù)據(jù)、原植物來源及中藥傳統(tǒng)應用融合在一起，并且提供三維結構信息，所以它可以幫助科研人員充分了解中國天然產(chǎn)物資源。
     因此，在中國的新藥、天然產(chǎn)物及相關領域的研究與開發(fā)工作中，CNPD^TM 是一個*的好工具。

升級/ 補充
     中國科學家在對天然產(chǎn)物及中草藥的研究中積累了大量的信息資源。CNPDTM 將通過版本升級來充實和完善數(shù)據(jù)庫，包括新條目的補充以及條目內(nèi)容的增加、更新等。新版的CNPDTM 中還增加用于虛擬篩選的三維結構數(shù)據(jù)庫，為用戶在使用其他的分子模擬和設計軟件系統(tǒng)方面提供更多的方便。