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CY3-NHS ester, Cyanine3-NHS, Cy3@SE
閱讀:1992 發(fā)布時間:2018-8-2產(chǎn)品描述
Cyanine3(Cy3),是花青素?zé)晒馑厝玖霞易宓某蓡T之一,是化學(xué)合成的聚甲炔染料。目前Cyanine系列染料以兩種異構(gòu)體的形式供貨,一種是非磺化花青素(non-sulfonated cyanines),一種是磺化花青素(sulfonated cyanine)。兩者的光譜性質(zhì)幾乎一致,因此大部分應(yīng)用可相互替換,比如,都可用于標(biāo)記DNA或蛋白等生物分子。兩者的主要區(qū)別在于:磺化染料是水溶性的,在水相的標(biāo)記反應(yīng)體系內(nèi)不需要使用有機(jī)共溶劑,并且降低染料在水中聚集的可能性,增強(qiáng)標(biāo)記效率。
本Cyanine 3(Cy3)是以磺化染料的形式供貨,易溶于水,Ex=555 nm,Em=565 nm,具有明亮熒光,光穩(wěn)定性強(qiáng),pH非敏感性等優(yōu)點(diǎn),適用于標(biāo)記多肽、蛋白以及核酸等生物分子,以通過后續(xù)熒光成像以及其他熒光生物學(xué)方法分析目的蛋白。
本Cy3 NHS ester,即含N-羥基琥珀酰亞胺(N-Hydroxysuccinimide)活化基團(tuán)的Cy3,可直接與生化分子上的氨基(-NH2)反應(yīng)形成穩(wěn)定的酰胺鍵,主要是伯胺。
產(chǎn)品簡介:
英文別名(English Synonym) | Cyanine 3, monosuccinimidyl ester |
分子量(Molecular Weight) | 829.03 |
外觀(Appearance) | 紫色固體 |
Ex/Em | 555nm/565nm |
溶解性(Solubility) | 溶于DMSO,DMF,水 |
結(jié)構(gòu)式(Structure) |
供應(yīng)商:西安凱新生物科技有限公司
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運(yùn)輸和保存方法
冰袋運(yùn)輸。-20℃干燥避光保存,有效期1年。
注意事項(xiàng)
1)NHS ester基團(tuán)對濕度非常敏感,務(wù)必干燥保存產(chǎn)品。使用前產(chǎn)品需放到室溫回溫至少20min。
2)NHS ester基團(tuán)的水解發(fā)生在水溶性緩沖體系屬于競爭性反應(yīng)。對蛋白/多肽(濃度:1-1mg/ml)伯胺的連接反應(yīng)建議在pH 7-9范圍內(nèi)進(jìn)行。使用不含氨基的緩沖體系,pH 7-9。比如100 mM 磷酸鈉,150 mM 氯化鈉, pH 7.5; 100mM Hepes, pH 7.5。100 mM 碳酸鈉/碳酸氫鈉, pH 8-9;或100mM 硼酸緩沖液, pH 8-9。
3)不要使用含伯胺的任何緩沖液,比如Tris,甘氨酸。
4)為了您的安全和健康,請穿實(shí)驗(yàn)服并戴一次性手套操作。
使用方法(用Cy3-NHS Ester 標(biāo)記抗體)
【注意】:可參考本方法進(jìn)行多肽,蛋白或者其他分子的標(biāo)記,需要根據(jù)具體的實(shí)驗(yàn)體系對合適的標(biāo)記緩沖體系,樣本濃度,染料濃度等參數(shù)做出合適的調(diào)整。
1)用不含氨基的合適的緩沖液(eg.100mM磷酸鈉,150mM NaCl, pH7.5)溶解抗體使其濃度達(dá)到1-5mg/ml?!?strong>注】:如抗體中有殘留Tris或 glycine 污染,則需透析或者脫鹽到合適的緩沖液內(nèi)。
2)使用前,用適量去離子水或者無水DMSO溶解Cy3-NHS,使其摩爾濃度為抗體摩爾濃度的400倍,例如,待標(biāo)記的IgG濃度為1mg/ml(eg 6.7?M),則溶解后Cy3-NHS的濃度為2.7mM;如待標(biāo)記的IgG濃度為2.5mg/ml,則溶解后Cy3-NHS的濃度為6.75mM;
3)向抗體中加入適量Cy3-NHS試劑,以達(dá)到預(yù)期的標(biāo)記效率?!?strong>注】:當(dāng)用Cy 3 NHS ester標(biāo)記抗體或其他蛋白,亮度的偶聯(lián)物其染料/蛋白的比率為4-12,取決于特定的應(yīng)用。過高比率會增加非特異性背景,喪失抗體特異性結(jié)合,導(dǎo)致聚集。建議根據(jù)應(yīng)用優(yōu)化標(biāo)記比率。
4)室溫孵育60min(或更長);
5)利用合適緩沖液透析或脫鹽柱去除未反應(yīng)的試劑;
6)分別在280nm和550nm檢測Cy3-抗體的吸光值;
7)測定Cy3標(biāo)記效率(DOL)和標(biāo)記濃度。見下公式。
公式一. 利用下面公式計算Cy3標(biāo)記效率(DOL)及其濃度(mg/ml) |
Eq.1 Number of Cy3 dye per protein=molarity Cy3 dye / molarity protein |
Eq.2 [Molarity of Cy3 dye]=A555/ε555 |
Eq.3 [Molarity of protein]=A280C/ε280 |
Eq.4 mg/ml=[A280-(A555×0.08)/(E1%/10)]×dilution factor |
【注】上述參數(shù)如下: A555=conjugate absorbance at 555±2nm ε555=molarextinction coefficient Cys dye =150000M-1cm-1 A280= conjugate absorbance at 280nm A280C =corrected conjugate absorbance at 280nm= A280-( A555×0.08) ε280= molarextinction coefficient protein(M-1cm-1)=MWp×E1%/10 |
應(yīng)用舉例:
用高于抗體摩爾濃度20倍的Cy3-NHS標(biāo)記 0.1 ml山羊IgG(濃度為1mg/ml)。標(biāo)記后脫鹽去除未標(biāo)記染料,在PBS中測定(1:5稀釋)測定其A280和A555:
A280=0.2906
A555=0.9825
另:山羊IgG分子量為150kDa, E1%=13.6 or 204000M-1cm-1
計算DOL如下:
By Equation 2 Molarity of Cy3 dye=0.9825/150000 M-1cm-1=6.55?M
By Equation 3 Molarity of IgG =0.2906-(0.9825×0.08)/204000 M-1cm-1=1.039?M
By Equation 1 number of Cy3 per IgG=6.55?M/1.039?M=6.3
則計算Cy3-IgG protein 濃度為(mg/ml):
By Equation 4 mg/ml=[0.2906-(0.9825×0.08)/1.36]×5=0.78mg/ml
Cy3 NHS酯:
Cy3 NHS酯是標(biāo)記生物分子氨基的活性染料,此試劑可標(biāo)記溶解蛋白,多肽和寡核苷酸/DNA。對于比較敏感的蛋白請選擇無需任何共溶劑的,可溶于水的磺酸基-Cy3 NHS酯。
分子結(jié)構(gòu):
一般性質(zhì):
外觀:紅色粉末
分子量:590.15
質(zhì)譜分析M+增量:474.2
分子式:C34H40ClN3O4
溶解性:溶于有機(jī)溶劑(DMF,DMSO,二氯甲烷),不溶于水
質(zhì)控:NMR 1H(95%)和13C,TLC,功能測試
光譜性質(zhì):
激發(fā)波長:555nm
在激發(fā)波長下的消光系數(shù):150000Lmol-1cm-1
發(fā)射波長:570nm
熒光量子產(chǎn)率:0.31
供應(yīng)商:西安凱新生物科技有限公司
Cy5 NHS酯:
Cy5在生命科學(xué)研究和診斷領(lǐng)域是非常常用的熒光團(tuán)。此熒光團(tuán)在紅色區(qū)域有發(fā)射,許多CCD檢測器有靈敏度。
Cy5 NHS酯是標(biāo)記多肽,蛋白和寡核苷酸的活性染料。染料需要少量的有機(jī)共溶劑(比如DMF和DMSO)溶解后進(jìn)行標(biāo)記反應(yīng)。此試劑可以標(biāo)記溶解蛋白和各種多肽,寡核苷酸的氨基。對于易降解的蛋白,不可使用DMF或DMSO,應(yīng)選擇我們的不需任何共溶劑的sulfo-Cy5 NHS酯,兩者具有非常相似的熒光特性。
分子結(jié)構(gòu):
一般性質(zhì):
外觀:暗藍(lán)色粉末
分子量:616.19
分子式:C36H42ClN3O4
溶解性:易溶于有機(jī)溶劑(DMF,DMSO和氯化物),難溶于水
質(zhì)控:NMR 1H(95%)和13C,TLC,功能測試
光譜性質(zhì):
激發(fā)波長:646nm
在激發(fā)波長下的消光系數(shù):250000 mol-1cm-1
發(fā)射波長:662nm
熒光量子產(chǎn)率:0.2
供應(yīng)商:西安凱新生物科技有限公司
Cy 3.5 NHS酯:
Cy3.5 NHS酯是標(biāo)記多肽,蛋白和寡核苷酸的活性染料
Cy3.5 NHS酯可替代Alexa Fluor 594,DyLight 594的NHS酯
分子結(jié)構(gòu):
一般性質(zhì):
外觀:暗紫色粉末
分子量:732.35
分子式:C45H50ClN3O4
溶解性:溶于有機(jī)溶劑(DMF,DMSO,二氯甲烷),不溶于水
質(zhì)控:NMR 1H(95%)和13C,TLC,功能測試
光譜性質(zhì):
激發(fā)波長:591nm
在激發(fā)波長下的消光系數(shù):116000Lmol-1cm-1
熒光量子產(chǎn)率:0.35
供應(yīng)商:西安凱新生物科技有限公司
Cy 5.5 NHS酯:
Cy5.5 NHS酯標(biāo)記多肽,蛋白和寡核苷酸的氨基
Cy5.5 NHS ester:是近紅外染料,除了用于標(biāo)記多肽,蛋白和寡核苷酸氨基的活性染料,可用于后續(xù)的小動物活體成像實(shí)驗(yàn)。
染料可代替Alexa Fluor 680 NHS ester和DyLight 680 NHS ester
分子結(jié)構(gòu):
一般性質(zhì):
外觀:深藍(lán)色粉末
分子量:716.31
分子式:C44H46ClN3O4
溶解性:溶于有機(jī)溶劑(DMSO,DMF,二氯甲烷),在水中不易溶解
質(zhì)控:NMR 1H(95%)13C,TLC,功能測試
光譜性質(zhì):
激發(fā)波長:673nm
在激發(fā)波長下的消光系數(shù):209000Lmol-1cm-1
發(fā)射波長:707nm
熒光量子產(chǎn)率:0.2
供應(yīng)商:西安凱新生物科技有限公司
ROX NHS酯,純6-異構(gòu)體:
ROX(羅丹明X又叫R101)是具有多種用途的高熒光性,不感光的羅丹明染料。ROX標(biāo)記的寡核苷酸探針經(jīng)常被用于qPCR及具有ROX通道的qPCR設(shè)備
標(biāo)記多肽,蛋白和氨基-寡核苷酸的活性染料,此染料可代替Alexa Fluor 568
分子結(jié)構(gòu):
一般性質(zhì):
外觀:深紅色粉末
分子量:631.67
質(zhì)譜分析M+增量:516.2
分子式:C37H33N3O7
CAS號:117491-83-5
溶解性:易溶于有機(jī)溶劑(DMF,DMSO),略溶于水
質(zhì)控:NMR 1H(95%)和13C,TLC,功能測試
光譜性質(zhì):
激發(fā)波長:570nm
激發(fā)波長下的消光系數(shù):82000Lmol-1cm-1
發(fā)射波長:591nm
熒光量子產(chǎn)率:1.0
供應(yīng)商:西安凱新生物科技有限公司
Cy7 NHS 酯:
氨基活性Cy7,近紅外染料。此試劑可被用于產(chǎn)生Cy7-標(biāo)記的生物分子,用于后續(xù)的小動物活體成像研究,藥物(http://www.chemdrug。。com/)設(shè)計及相關(guān)實(shí)驗(yàn)。Cy7中心加強(qiáng)聚亞甲基鏈的結(jié)構(gòu)特點(diǎn),與母結(jié)構(gòu)相比其量子產(chǎn)率提高了20%,增加了其熒光亮度。
分子結(jié)構(gòu):
一般性質(zhì):
外觀:綠色粉末
分子量:682.29
分子式:C41H48ClN3O4
溶解性:溶于有機(jī)溶劑(DMSO,DMF,二氯甲烷),不易溶于水
質(zhì)控:NMR 1H(95%)13C,TLC,功能測試
光譜性質(zhì):
激發(fā)波長:750nm
在激發(fā)波長下的消光系數(shù):199000Lmol-1cm-1
發(fā)射波長:773nm
熒光量子產(chǎn)率:0.3
供應(yīng)商:西安凱新生物科技有限公司
Cy7.5 NHS 酯:
Cy7.5是近紅外染料,具有長的發(fā)射波長,近紅外照射容易穿透組織,可用于小動物活體成像實(shí)驗(yàn)。Cy7.5中心加強(qiáng)聚亞甲基鏈的結(jié)構(gòu)特點(diǎn),與母結(jié)構(gòu)相比其量子產(chǎn)率提高了20%,增加了其熒光亮度。
分子結(jié)構(gòu):
一般性質(zhì):
外觀:綠色粉末
分子量:782.41
分子式:C49H52ClN3O4
溶解性:溶于有機(jī)溶劑(DMSO,DMF,二氯甲烷),不易溶于水
質(zhì)控:NMR 1H(95%)13C,TLC,功能測試
光譜性質(zhì):
激發(fā)波長:788nm
在激發(fā)波長下的消光系數(shù):223000Lmol-1cm-1
發(fā)射波長:808nm
熒光量子產(chǎn)率:0.3
供應(yīng)商:西安凱新生物科技有限公司
Sulfo-Cy3 NHS酯:
此染料可溶于水,氨基活性Cy3染料。在水溶液中有效標(biāo)記蛋白和多肽,無需共溶劑,是低溶解性蛋白和易于降解蛋白的理想選擇。
此染料是磺化,親水性染料。可以代替Alexa Fluor 546和DyLight 549
分子結(jié)構(gòu):
一般性質(zhì):
外觀:深紅色晶體
分子量:735.8
分子式:C34H38N3NaO10S2
溶解性:極易溶于水,易溶于有機(jī)溶劑(DMF,DMSO)
質(zhì)控:NMR 1H(95%)和13C,TLC,功能性測試
光譜性質(zhì):
激發(fā)波長:548nm
激發(fā)波長下的消光系數(shù):162000Lmol-1cm-1
發(fā)射波長:563nm
熒光量子產(chǎn)率:0.1
供應(yīng)商:西安凱新生物科技有限公司
Sulfo-Cy5 NHS酯:
水溶性Cy5 NHS酯,用于標(biāo)記生物分子的氨基,無需任何共溶劑,因此可以用于標(biāo)記在有機(jī)溶劑中易降解的蛋白和溶解性低的蛋白
Cy5 是***常用的熒光團(tuán)之一,與多種設(shè)備兼容,比如平板讀數(shù)儀,顯微鏡和成像儀
此染料是高水溶性,可以代替多種用途的Alexa Fluor 647,DyLight 649
分子結(jié)構(gòu):
一般性質(zhì):
外觀:深藍(lán)色粉末
分子量:761,84
分子式:C36H40N3NaO10S2
溶解性:極易溶于水,易溶于有機(jī)溶劑DMF和DMSO
質(zhì)量控制:NMR 1H (95%)和13C,TLC,功能性測試
光譜性質(zhì):
激發(fā)波長:646nm
激發(fā)波長下的消光系數(shù):271000Lmol-1cm-1
發(fā)射波長:662nm
熒光量子產(chǎn)率:0.2
供應(yīng)商:西安凱新生物科技有限公司
Sulfo-Cy7 NHS ester:
一般性質(zhì):
外觀:深綠色粉末
分子量:827.94
分子式:C41H46N3NaO10S2
溶解性:易溶于水,DMF,DMSO
質(zhì)控:NMR 1H(95%)13C,TLC,功能測試
光譜性質(zhì):
激發(fā)波長:740nm
在激發(fā)波長下的消光系數(shù):240600Lmol-1cm-1
發(fā)射波長:773nm
供應(yīng)商:西安凱新生物科技有限公司