在熱消毒過程中，普通的反滲透膜會(huì)發(fā)生退水現(xiàn)象，復(fù)合膜的基膜和復(fù)合膜都會(huì)發(fā)生一定范圍分子鏈排列構(gòu)型的變化（結(jié)晶度的提高）。變化的結(jié)果是膜的產(chǎn)水量下降，脫鹽率升高，類似于早期醋酸纖維膜的熱處理。美國(guó)海德能公司近期推出的熱消毒膜元件在粘結(jié)劑的選擇及粘結(jié)工藝方面也作了特殊處理，能夠保證在溫度變化時(shí)膜元件各部分的膨脹或收縮的整體一致性，膜元件不會(huì)發(fā)生開裂和變形。

熱消毒工藝過程：

1. 排放沖冼：排出系統(tǒng)中工作溶液，用反滲透產(chǎn)水對(duì)系統(tǒng)進(jìn)行低壓沖洗。
2. 低壓循環(huán)：保持系統(tǒng)操作壓力小于25PSI，用約45℃的反滲透水循環(huán)保45分鐘。
3. 升溫：在必要時(shí)將系統(tǒng)溫度升高到85℃，升溫速度不要超過每分鐘4℃。
4. 保溫：保溫30分鐘便可達(dá)到系統(tǒng)*消毒。
5. 冷卻：降低速度不要超過每分鐘7℃。
6. 系統(tǒng)沖洗：用反滲透產(chǎn)水沖洗系統(tǒng)。

由于熱消毒對(duì)反滲透膜及水處理系統(tǒng)中各元?dú)饧⒐┧苈范加袊?yán)格的要求；其運(yùn)行成本勢(shì)必增中。同時(shí)，熱消毒過程控制較復(fù)雜，尤其是溫度控制方面難于實(shí)現(xiàn)。 

目前，因?yàn)闊嵯灸み€沒有被廣泛采用，所以熱消毒只局限于供水管路方面。德國(guó)勞爾公司在加熱升溫系統(tǒng)設(shè)計(jì)采用了在線過流式加熱系統(tǒng)，實(shí)現(xiàn)了對(duì)供水管路的熱消毒，但價(jià)格十分昂貴。