詳細(xì)介紹
美國Bd 單細(xì)胞分析系統(tǒng)Rhapsody TM
平行分析數(shù)千個單細(xì)胞內(nèi)數(shù)百個基因的表達(dá)水平
產(chǎn)品詳情
當(dāng)對序列讀取進(jìn)行計數(shù)時,PCR擴增偏差可導(dǎo)致基因定量不準(zhǔn)確。BD的分子標(biāo)簽技術(shù)為單個細(xì)胞的單個基因分配了*的分子索引,也稱為“分子條形碼”。實驗者可借此克服擴增偏差,更準(zhǔn)確地計算轉(zhuǎn)錄水平。
數(shù)千個單細(xì)胞數(shù)百個基因的平行分析
單線胞RNAscq正在改變我們對細(xì)胞的理爭。BD Rhapsody TM 單細(xì)胞分析系弘基于BD在細(xì)胞生物學(xué)領(lǐng)域40年的專業(yè)技術(shù),滿足您的實驗需求,在單細(xì)胞水平理解細(xì)胞形態(tài)和功能。
這種全新的分析系統(tǒng)克服了傳統(tǒng)檢測的局限性,例如,微陣列和大量細(xì)胞RNAscq,這些檢測通過實驗對各個細(xì)胞之間的微妙差異的觀察,依賴于對多個細(xì)胞的平均檢測。用戶可以鑒定和表征新型和罕見細(xì)胞類型。其進(jìn)一步幫助理解從免疫學(xué)到腫瘤學(xué)等各個領(lǐng)域內(nèi)的生物學(xué)過程。
BD Rhapsody 單細(xì)胞分析系統(tǒng)能對成千上萬個單細(xì)胞的數(shù)百個基因進(jìn)行數(shù)字定量,提供足夠靈活的定制測定法以滿足任何實驗需要,其有效系統(tǒng)可縮短實驗時間和降低測序成本。
系統(tǒng)組件包括:
。BD Rhapsody 掃描儀
。BD Rhapsody 上樣臺
。BD Rhapsody 卡片芯片
。分子標(biāo)簽試劑和文庫制備
。特定應(yīng)用的靶向檢測試劑盒(pancl)
為您的實驗定制工作流程
對于不同用戶和實驗,單細(xì)胞實驗工作流程往往需要不同程度的樣本操作、質(zhì)量和通量。BD儀器選項可以根據(jù)具體需求進(jìn)行配置。BD FACS分選機(如BD FACSMelody )是BD Rhapsody系統(tǒng)上游樣本富集的良好選擇。BD Rhapsody掃描儀提供自動化細(xì)胞計數(shù)和細(xì)胞樣本活性測試,幫助用戶制備適用于卡式芯片單細(xì)胞捕獲的濃度的樣本。掃描儀提供了卡式芯片上微球捕獲細(xì)胞的計數(shù)。BD Rhapsody上樣臺輕巧便攜,可在實驗室內(nèi)輕松移動。同樣還提供生物信息學(xué)途徑和可視化工具。這些工具包括UMI分析算法和可視化工具,即使沒有經(jīng)驗的用戶也可分析和理解單細(xì)胞數(shù)據(jù)。
更有效的測序可以更低的成本實現(xiàn)更高的通量
由于與高通量實驗方法相關(guān)的測序成本,單細(xì)胞實驗往往非常昂貴。BD Rhapsody單細(xì)胞分析系統(tǒng)設(shè)計有多個功能,可以更有效地利用測序來降低實驗成本。
· 靶向測定-由于檢測靈敏度的提高,特定的基因組合方法可使用少量的時間和成本,幫助產(chǎn)生類似于全轉(zhuǎn)錄組分析(Whole Transcriptome Analysis,WTA)測定的結(jié)果。這種方法還提高了UMI計數(shù)效率,從而極大程度的節(jié)省了實驗時間和成本。
· 儲存-從樣本中得到的完整cDNA可在磁性微球上穩(wěn)定存儲,允許將珍貴樣本保存長達(dá)16周。這可使用戶在時間允許的情況下靈活地對樣本進(jìn)行測序,并通過對儲存的微球池進(jìn)行等分或分樣來實現(xiàn)同一樣本的多個測定。
· 分樣—在磁性微球上儲存的cDNA A可以分成一個或多個等分試樣,并使用定制或預(yù)先設(shè)計的組合(panel)進(jìn)行擴增。通過提供對部分樣本進(jìn)行測序的選項和對樣本不同組合(panel)進(jìn)行測試的靈活性,分樣可降低成本。
使單細(xì)胞測序效率更高
靶向方法對單細(xì)胞分析的益處通過使用競爭產(chǎn)品的WTA測定和BD Rhapsody免疫反應(yīng)組合(panel)(人)在相似的測序深度下對外周血單核細(xì)胞(PBMC)進(jìn)行表達(dá)譜分析來證明。雖然兩種測定方法的t-SNE表達(dá)譜分析都顯示了已知PMBC細(xì)胞類型的聚類結(jié)果,靶向組合(panel)顯示了比WTA更高的靈敏度(讀數(shù)/細(xì)胞)和UMI計數(shù)效率。BD Rhapsody測定實現(xiàn)了與競品WTA測定類似的聚類性能,而測序讀數(shù)降低了近10倍(靶向讀數(shù)2k vs. WTA讀數(shù)20k)。與使用WTA方法不同,靶向組合(panel)避免了對多個高表達(dá)基因的測序如核糖體蛋白或低表達(dá)變異性,從而提高測定效率。