賽默飛ABI Ion Proton基因測(cè)序儀采用了新一代半導(dǎo)體測(cè)序技術(shù)。此前推出的同樣基于這一技術(shù)的個(gè)人化操作基因組測(cè)序儀 (PGM? ) ,已成為銷(xiāo)售*快的測(cè)序儀。Ion 技術(shù)擁有快速、簡(jiǎn)單及可擴(kuò)展等特征,能有效推進(jìn)臨床研究在遺傳性疾病等診斷中的發(fā)展。
2. 應(yīng)用領(lǐng)域
可應(yīng)用于人全基因組、外顯子組、轉(zhuǎn)錄組測(cè)序。
3. 性能介紹
1) 單芯片載入中:為實(shí)現(xiàn)優(yōu)化的性能和簡(jiǎn)便性,IonProton?系統(tǒng)提供了全新設(shè)計(jì)的芯片加載機(jī)制。
2) 集成的試劑輸送:IonProton?測(cè)序儀將所有試劑置于儀器前方的單扇門(mén)之后,十分方便。
3) 直觀的圖形界面:Ion Proton?測(cè)序儀采用了全新設(shè)計(jì)且易于使用的直觀圖形界面,確保了各個(gè)水平的用戶(hù)均能通過(guò)儀器設(shè)置和操作快速導(dǎo)航。
4) *優(yōu)的電子產(chǎn)品:Ion Proton?測(cè)序儀采用了優(yōu)的電子技術(shù),可*大程度地簡(jiǎn)化處理高通量系統(tǒng)生成的數(shù)據(jù)所需的計(jì)算硬件。
5) 離子半導(dǎo)體測(cè)序芯片:Ion Proton?芯片只需幾小時(shí)即可提供人類(lèi)基因組、人類(lèi)外顯子組或整個(gè)轉(zhuǎn)錄組信息,較其它測(cè)序技術(shù)更快速。
4. 數(shù)據(jù)產(chǎn)出
單次運(yùn)行時(shí)間為2h,Ion PI?芯片包括16,500萬(wàn)個(gè)反應(yīng)孔,測(cè)序通量為2個(gè)人外顯子組大小,Ion PII?芯片包括66,000萬(wàn)個(gè)反應(yīng)孔,測(cè)序通量為1個(gè)人基因組大小。
5. 工作流程
文庫(kù)構(gòu)建-模板制備-運(yùn)行測(cè)序-分析數(shù)據(jù)
6. 系統(tǒng)數(shù)據(jù)處理編輯
采用優(yōu)的硬件可實(shí)現(xiàn)一天基因組測(cè)序
IonProton?系統(tǒng)是能夠?qū)崿F(xiàn)$1,000基因組的序平臺(tái)*。它將是可在一天內(nèi)提供人類(lèi)基因組規(guī)模分析的臺(tái)儀器系統(tǒng),包括數(shù)據(jù)處理、堿基檢測(cè)和變異體檢測(cè)。
IonProton?系統(tǒng)采用半導(dǎo)體技術(shù),可提供在幾個(gè)小時(shí)內(nèi)完成測(cè)序所需的速度,而且利用IonProton?測(cè)序儀中優(yōu)的電子設(shè)備,能夠一天內(nèi)在Proton?Torrent服務(wù)器—IonProton?系統(tǒng)附帶的簡(jiǎn)單的臺(tái)式服務(wù)器—上實(shí)現(xiàn)變異體檢測(cè)。
IonProton?測(cè)序儀采用了*新、*優(yōu)的計(jì)算硬件(圖形處理器(GPU)和現(xiàn)場(chǎng)可編程門(mén)陣列(FPGA)技術(shù)),可在測(cè)序儀內(nèi)部實(shí)現(xiàn)密集型計(jì)算數(shù)據(jù)處理。隨后在Proton?Torrent服務(wù)器上進(jìn)行計(jì)算密集程度較低的堿基檢測(cè)和變異體檢測(cè)。
IonProton?系統(tǒng)將提的速度和價(jià)格優(yōu)勢(shì),可在臺(tái)式測(cè)序儀和臺(tái)式服務(wù)器上實(shí)現(xiàn)外顯子組、轉(zhuǎn)錄組和人類(lèi)基因組測(cè)序,而直到現(xiàn)在,完成這些操作仍需體積較大的測(cè)序儀和集群。
7. 優(yōu)勢(shì)編輯
IonProton?測(cè)序儀憑借密度比IonPGM?測(cè)序儀高1000倍的芯片,IonProton?測(cè)序儀將使得全基因組測(cè)序?qū)γ總€(gè)實(shí)驗(yàn)室都觸手可及。
基于新一代的半導(dǎo)體測(cè)序技術(shù),此技術(shù)已讓IonPGM?測(cè)序儀成為世界上銷(xiāo)售*快的測(cè)序儀.新的高通量芯片將實(shí)現(xiàn)讓IonProton?測(cè)序儀與IonPGM?測(cè)序儀相當(dāng)?shù)倪\(yùn)行單日流程,來(lái)完成單個(gè)人類(lèi)基因組的測(cè)序。
適合于每個(gè)實(shí)驗(yàn)室,各種應(yīng)用,各種預(yù)算。
快速、簡(jiǎn)捷、擴(kuò)展,臺(tái)式基因組中心。
天津金思德生物擁有中低通量的Ion Torrent PGM Systems和中高通量的Ion Torrent Proton Systems,為用戶(hù)提供專(zhuān)業(yè)全套的二代測(cè)序?qū)嶒?yàn)室整體解決方案。
賽默飛ABI Ion Proton基因測(cè)序儀:
快的高通量新一代測(cè)序工作流程與快的測(cè)序運(yùn)行時(shí)間2-4小時(shí)的離子PI芯片
每周高數(shù)量完整測(cè)序的運(yùn)行,具有簡(jiǎn)單和自動(dòng)化的工作流(與離子的OneTouch2系統(tǒng)中使用時(shí))
簡(jiǎn)單的半導(dǎo)體測(cè)序工作流程與強(qiáng)大的和簡(jiǎn)單的硬件,可以在-沒(méi)有攝像頭的依據(jù),沒(méi)有光學(xué),沒(méi)有激光
可擴(kuò)展,高通量測(cè)序能力,使運(yùn)行時(shí)要么離子PI或離子的PII*芯片,再加上高達(dá)200基單讀取和靈活的庫(kù)選項(xiàng)(例如,基因組DNA段,
有針對(duì)性的/外顯子,RNA)
小型臺(tái)式足跡和安裝能力(帶有可選的機(jī)架)(每個(gè)機(jī)架上有兩個(gè)離子質(zhì)子系統(tǒng)),為客戶(hù)提供唯的臺(tái)式基因組中心
低成本的平臺(tái)和價(jià)格誘人的半導(dǎo)體芯片和試劑的應(yīng)用范圍
經(jīng)過(guò)驗(yàn)證的離子半導(dǎo)體測(cè)序無(wú)需復(fù)雜的光學(xué)系統(tǒng),并采用天然的核苷酸,以提供高度準(zhǔn)確的變異檢測(cè),覆蓋均勻性和靈敏度,檢測(cè)低頻率變量
快速和簡(jiǎn)單的解決方案庫(kù)范圍和試劑盒與各種應(yīng)用,如基因組測(cè)序,外顯子組測(cè)序,基因組測(cè)序和RNA測(cè)序低投入的要求
完整的端至端解決方案,從基本要求與質(zhì)子洪流服務(wù)器和洪流,以變種Suite軟件V3.0
簡(jiǎn)單和集成的工具,三級(jí)數(shù)據(jù)分析與跨越單一離子記者軟件進(jìn)行DNA變異分析,配對(duì),或者三人的樣本有了突破性離子質(zhì)子系統(tǒng)的可用性,
快速,高通量測(cè)序終于進(jìn)入所有實(shí)驗(yàn)室。
負(fù)擔(dān)得起的測(cè)序幾乎每一個(gè)實(shí)驗(yàn)室上一頁(yè)測(cè)序技術(shù)都依賴(lài)于光學(xué)系統(tǒng)的化學(xué)和序列信息的數(shù)字形式之間的橋梁。這些系統(tǒng)增加了巨大的成本來(lái)定序,
他們貶謫到只有大的實(shí)驗(yàn)室。通過(guò)省去了光學(xué)系統(tǒng),離子質(zhì)子系統(tǒng)提供了高通量測(cè)序更簡(jiǎn)單,更快速,更具成本效益,
并比其他任何可用的技術(shù)更具可擴(kuò)展性。與臺(tái)式足跡,低成本的測(cè)序試劑,和一個(gè)簡(jiǎn)單的觸摸屏用戶(hù)界面,離子質(zhì)子系統(tǒng)帶來(lái)了高吞吐量,
下一代測(cè)序幾乎每一個(gè)實(shí)驗(yàn)室。
離子動(dòng)力:PostLight測(cè)序產(chǎn)生位從基地的測(cè)序技術(shù)的基礎(chǔ)離子質(zhì)子系統(tǒng)利用了充分表征的生化過(guò)程:當(dāng)一個(gè)核苷酸摻入到DNA鏈通過(guò)聚合酶,
氫離子(H +)被釋放作為副產(chǎn)物。這種氫離子帶電荷的質(zhì)子系統(tǒng)的離子傳感器本質(zhì)上是世界上小的固態(tài)pH計(jì),可以檢測(cè)到。
由于序充斥芯片與一個(gè)又一個(gè)核苷酸,核苷酸任何添加到DNA模板將被檢測(cè)為電壓的變化,以及離子質(zhì)子系統(tǒng)會(huì)調(diào)用基。
如果一個(gè)核苷酸是不匹配的特定模板,沒(méi)有電壓變化將被檢測(cè)并沒(méi)有基礎(chǔ),直接調(diào)用該模板。
大規(guī)模平行測(cè)序在你的臺(tái)式離子質(zhì)子系統(tǒng)的一個(gè)主要組成部分是測(cè)序芯片。離子PI芯片集成了一個(gè)非常密集陣嫁給我們的專(zhuān)有離子傳感器> 1.65億微機(jī)械井。
每孔包含不同的DNA模板,使大規(guī)模并行測(cè)序。與離子PI芯片(1.65億井)和離子的PII芯片*(6.6億井),離子質(zhì)子系統(tǒng)能使全轉(zhuǎn)錄到
整個(gè)人類(lèi)基因組測(cè)序的范圍從以人為尺度的外顯子組測(cè)序的高通量基因組應(yīng)用。
正確的工具來(lái)獲得的成績(jī)輕松,可靠并迅速因?yàn)樗鼨z測(cè)核苷酸摻入無(wú)需使用光,離子質(zhì)子系統(tǒng)采用簡(jiǎn)單的測(cè)序化學(xué)可能:天然核苷酸。
沒(méi)有必要使用昂貴的且易于出錯(cuò)的修飾的堿基,酶級(jí)聯(lián)反應(yīng),化學(xué)發(fā)光,或熒光。直接檢測(cè)也意味著每個(gè)核苷酸的摻入被記錄在幾秒鐘。
因此,你可以做一個(gè)完整的測(cè)序通常在幾小時(shí)內(nèi)運(yùn)行。