生物安全實驗室建設(shè)與規(guī)劃至少應遵從以下原則：
科學合理的原則
傳染性和致病性再強的病原微生物，只要它不和人體接觸，感染就不會發(fā)生。
1．屏障原理
把病原體圍場在一定空間范圍內(nèi)，使之避免暴露在開放的環(huán)境中，操作者間接對其操作(如手套、機械手等)，在圍場內(nèi)接觸的空氣和水體經(jīng)過處理后排放。在實驗室內(nèi)使用的生物安全柜，實驗室設(shè)施均屬此類。
2．過濾原理
在圍場(包括安全柜和實驗室)內(nèi)接觸的空氣均視為污染的有害物質(zhì)，把實驗室內(nèi)空氣經(jīng)過HEPA濾器過濾后或其他凈化后排放，以保護環(huán)境。
3．消毒滅菌原理
實驗室污染區(qū)和半污染區(qū)的一切物品，包括空氣、水體和所有的表面(儀器)等均被視為污染有危害的。所以都要對其消毒處理，特別是對實驗后的廢液，器材和手套務必嚴格處理。廢液廢物在拿出實驗室之前務必滅菌。在實驗完成后撤離實驗室過程中每一步要用有效消毒把好關(guān)，以防有害因子的泄漏。
4．個人防護原理
由于屏障的作用不可能是可靠，萬一操作中有所疏漏也是很危險的，所以要按要求做好個人防護。個人防護要適宜、科學。建議個人防護分三級。一級防護用于BSL-1和BSI．-2，二級防護用于BSI．-3，三級防護用于BSL-4。
安全的原則
安全是修造實驗室的直接目的，建造中一切不利安全的設(shè)計都應取締，一切與生物安全有沖突的參數(shù)設(shè)計都應服從安全的要求。例如：凈化要求要服從安全，使用方便服從安全，節(jié)約服從安全，人性化服從安全。
軟件在先的原則
修造實驗室前做好對擬從事的病原微生物和研究內(nèi)容的危險評估，一定要有科學、合理的總體構(gòu)思和概念設(shè)計。在此基礎(chǔ)上要根據(jù)操作過程的梗概進行平面布局工藝設(shè)計，然后再進行空調(diào)通風和電控等的具體設(shè)計。
管理嚴格的原則
一定要按照發(fā)布的《病原微生物實驗室生物安全管理條例》進行管理。這個條例對致病微生物的管理原則是：病原微生物是分類管理，實驗室是分級管理。
遠離病原的原則
修建實驗室是為了研究致病微生物和高致病微生物，必要的實驗必須在實驗室內(nèi)進行。但是，非必要的時候盡可能少接觸病原體或少進實驗室。例如，能在半污染區(qū)做的不進污染區(qū)；能在清潔區(qū)做的不進半污染區(qū)；進實驗室2人能完成不用3人；無關(guān)人員不進實驗室。使用實驗室后應及時凈化處理和滅菌，不要存留污物。不用的需要保存的菌(毒)液應送到保藏機構(gòu)保存。
預防為主的原則
從事病原微生物實驗活動，對實驗室感染應采取預防為主的原則，要把握三個環(huán)節(jié)，即：
1．實驗室要使用經(jīng)過生物和物理的檢測并且合格的安全柜、排風過濾器和高壓蒸汽滅菌器，確保達到零泄漏。
2．通過對實驗過程的安全監(jiān)測，發(fā)現(xiàn)問題要及時采取預防和改進措施。
3．發(fā)現(xiàn)有實驗室感染的征兆，要及時采取隔離治療措施，以防止出現(xiàn)二代病例。
使用方便的原則
實驗室建設(shè)在保證安全的前提下，應考慮工作過程中活動合理方便的問題。所以在制定方案時應該征求使用人的意見。
厲行節(jié)約的原則
在保證安全的前提下，應提倡節(jié)約的原則。保證安全的尺度是國標(GBl9489—2004)。安全性能要可靠，一切都要嚴格，講究實質(zhì)，功能齊全，合乎要求，但不求豪華。
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