微波滅菌機(jī)微波干燥原理：微波的電磁場(chǎng)能使物料中的極性分子隨著微波的震蕩頻率而相互摩擦，從而產(chǎn)生大量熱量，加速水分的蒸發(fā)。
微波殺菌機(jī)理：微波作用能改變生物性排列聚合狀態(tài)及其運(yùn)動(dòng)規(guī)律，而且微波場(chǎng)感應(yīng)的離子流，會(huì)影響細(xì)胞膜附近的電荷分布，導(dǎo)致膜的屏障作用受到損傷，影響Na-K泵的功能，產(chǎn)生膜功能障礙，從而干擾或破壞細(xì)胞的正常新陳代謝功能，導(dǎo)致細(xì)菌生長(zhǎng)抑制，停止或死亡，從而產(chǎn)生殺菌效果。另外，細(xì)胞中的核糖核酸（RNA）和脫氧核糖核酸（DNA）在微波場(chǎng)力作用下可導(dǎo)致氫鍵有松弛、斷裂或重組，誘發(fā)基因突變或染色體畸變，從而影響其生物活性的改變、延緩或中斷細(xì)胞的穩(wěn)定遺傳和增殖，這也是微波殺菌的另一原因。

微波滅菌機(jī)微波殺菌、保鮮是微波熱效應(yīng)共同作用結(jié)果。微波的熱效應(yīng)主要起快速升溫殺菌作用；而非熱效應(yīng)則使微生物體蛋白質(zhì)和生亙活性物質(zhì)變異，從而喪失活力或死亡。
 
因此微波殺菌溫度低于常規(guī)方法，一般情況下，常規(guī)方法殺菌溫度要求在100攝氏度以上，時(shí)間十幾分鐘至幾十分鐘，而微波殺菌溫度僅85攝氏度，時(shí)間為幾分鐘，幾乎能滿足各種物料的殺菌需要。