斑馬魚CRISPR基因編輯技術(shù)服務(wù),含基因敲入品系制備、基因敲入品系制備、轉(zhuǎn)基因品系制備等。
斑馬魚基因敲入品系制備
服務(wù)簡(jiǎn)介:
1. 基因敲入(Knock in)
非同源依賴的DNA修復(fù)技術(shù),在斑馬魚基因組定點(diǎn)插入外源DNA片段(熒光蛋白、PA等)。
2. 基因敲入技術(shù)特點(diǎn)
2.1 定點(diǎn)插入;
2.2敲入效率較低。
服務(wù)流程:
根據(jù)客戶基因敲入要求進(jìn)行基因分析;
cas9 mRNA和多個(gè)gRNA靶點(diǎn)的設(shè)計(jì)及合成;
高效gRNA靶點(diǎn)的篩選及效率驗(yàn)證;
敲入載體設(shè)計(jì)及構(gòu)建;
斑馬魚胚胎的顯微注射和敲入驗(yàn)證;
F0代斑馬魚的可遺傳性篩選;
雜合子F1代斑馬魚的基因型鑒定。
環(huán)特生物優(yōu)勢(shì):
斑馬魚敲入技術(shù)以及上百例的成功經(jīng)驗(yàn);
*的高效篩選方法。
案例展示:
斑馬魚基因敲除品系制備
服務(wù)簡(jiǎn)介
1.基因敲除(Gene Knockout)
根據(jù)給定GeneID或Gene name,分析基因保守結(jié)構(gòu)域,在保守結(jié)構(gòu)域或客戶區(qū)域設(shè)計(jì)靶點(diǎn)并制備靶點(diǎn)gRNA,gRNA和Cas9共注射使基因產(chǎn)生移碼突變,通過PCR篩選得到穩(wěn)定遺傳品系。
2. 基因敲除技術(shù)特點(diǎn)
2.1 通過將基因敲除斑馬魚品系與野生型相比較,研究者可以揭示特定基因的功能。
2.2 在基因組水平上將目標(biāo)基因敲除,遺傳背景干凈清晰,是研究基因功能的金標(biāo)準(zhǔn)。
服務(wù)流程
▲根據(jù)客戶提供的GeneID或Gene name進(jìn)行基因分析——▲cas9 mRNA和多個(gè)gRNA靶點(diǎn)的設(shè)計(jì)及合成——▲高效gRNA靶點(diǎn)的篩選及效率驗(yàn)證——▲F0代斑馬魚的可遺傳性篩選——▲雜合子F1代斑馬魚的基因型鑒定
環(huán)特生物優(yōu)勢(shì)
成熟的基因敲除技術(shù)快速獲得穩(wěn)定品系;
多靶點(diǎn)共注射F0代驗(yàn)證基因功能。
斑馬魚敲除品系成功案例
1、基因分析
分析目的基因的保守結(jié)構(gòu)域;
2、靶點(diǎn)篩選
設(shè)計(jì)4個(gè)gRNA靶點(diǎn),PCR檢測(cè)包含靶點(diǎn)的區(qū)域真實(shí)序列,顯微注射驗(yàn)證靶點(diǎn)效率;
3、大規(guī)模注射養(yǎng)殖F0
Cas9 pro+gRNA 共注射,共養(yǎng)殖 F0 約 80 條用于后期Founder篩選;
4、Founder 篩選
F0代斑馬魚與野生型外交,收集48hpf的F1胚胎抽取基因組,PCR鑒定,測(cè)序結(jié)果在靶點(diǎn)位置出現(xiàn)雙峰的認(rèn)為產(chǎn)生突變,然后TA clone驗(yàn)證其可能產(chǎn)生的突變方式;
5、F1 代篩選
F1代斑馬魚剪尾篩選,TA clone驗(yàn)證突變方式:
通過對(duì)測(cè)序圖譜的分析獲得突變方式為:-5bp,產(chǎn)生移碼突變的敲除斑馬魚;
通過對(duì)測(cè)序圖譜的分析獲得突變方式為:-4-3bp,產(chǎn)生移碼突變的敲除斑馬魚模型。
斑馬魚轉(zhuǎn)基因品系制備
服務(wù)簡(jiǎn)介
1. 轉(zhuǎn)基因
斑馬魚轉(zhuǎn)基因技術(shù)包括顯微注射、電穿孔技術(shù)(電脈沖介導(dǎo))、jingzi載體法、GAL4/UAS 轉(zhuǎn)錄激活系統(tǒng)、Tol2轉(zhuǎn)座子介導(dǎo)、擬型反轉(zhuǎn)錄病毒介導(dǎo)、重組桿狀病毒介導(dǎo)等方法。
2. 轉(zhuǎn)基因技術(shù)目的
2.1 通過定點(diǎn)敲除技術(shù)進(jìn)行基因鑒定和功能研究;
2.2 利用報(bào)告基因?qū)κ荏w等蛋白質(zhì)進(jìn)行功能研究;
2.3 構(gòu)建各種斑馬魚突變體,通過斑馬魚疾病模型進(jìn)行人類疾病研究和藥物篩選;
2.4 構(gòu)建含有特異性啟動(dòng)子的生物感應(yīng)器,用于環(huán)境監(jiān)測(cè)。
3. Tol2轉(zhuǎn)座子介導(dǎo)的轉(zhuǎn)基因技術(shù)優(yōu)點(diǎn)
3.1 Tol2轉(zhuǎn)座子可攜帶大片段DNA;
3.2 Tol2轉(zhuǎn)座子沒有位置偏好性,幾乎能整合到染色體的任意位置;
3.3 Tol2轉(zhuǎn)座子的耐受范圍很廣;
3.4 Tol2作為天然的具有自主轉(zhuǎn)座活性的脊椎動(dòng)物轉(zhuǎn)座子,能夠在胚胎發(fā)育的不同時(shí)期進(jìn)行有效的轉(zhuǎn)移;
3.5 Tol2轉(zhuǎn)座子介導(dǎo)的轉(zhuǎn)基因技術(shù)能夠有效克服外源基因在后代傳遞頻率低的技術(shù)難題。
服務(wù)流程
▲客戶提出轉(zhuǎn)基因品系制備需求→▲分析可行性→▲構(gòu)建載體→▲斑馬魚胚胎注射→▲founder篩選→▲F1代斑馬魚養(yǎng)殖→▲F2代斑馬魚養(yǎng)殖
環(huán)特生物優(yōu)勢(shì)
1.*的養(yǎng)殖方法可縮短服務(wù)周期;
2.豐富的經(jīng)驗(yàn)和及時(shí)溝通助力科研實(shí)驗(yàn)。
參考文獻(xiàn):
[1] 劉麗麗, 王健, 王海勝,等. 斑馬魚轉(zhuǎn)基因平臺(tái)的建立[J]. 生物技術(shù)通報(bào), 2013(010):120-126.
[2] 陶然, 常玉梅, 李世國(guó),等. Tol2轉(zhuǎn)座子的特性及其在轉(zhuǎn)基因魚類中的應(yīng)用[J]. 水產(chǎn)學(xué)雜志, 2014, 000(001):60-64.